社会構造のグローバル化に伴い、工業技術は多様化、専門化が急速に進み、厳しい国際競争にさらされている。工学研究科は、建学の精神である「全人教育」のもと、学部で培われた基礎知識と応用能力のうえに、広い識見を有し高度な専門的知識・技能を有する技術者および創造性豊かな優れた研究・開発能力を有する研究者等の育成を目指している。

大学院工学研究科は大きく分けて、物理系と生命工学系に分けられ、物理系は下記のように修士課程および博士課程より構成されている。
（生命工学系は当該のＨＰ参照）